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자연과학연구소는 수학, 물리학, 화학, 생명과학 연구부로 구성된 기초과학연구부와 8개의 부설연구센터로 구성되어 있다.
==화학과==
* 유기광전자재료연구실 : <nowiki>http://opem.campushomepage.com/index2.asp</nowiki>
* 표면분자과학연구실 : <nowiki>http://smsl.camhome.co.kr/index2.asp</nowiki>
* 분자유전공학연구실 : <nowiki>https://sites.google.com/site/hanyangmgel/</nowiki>
* 나노복합박막연구실 : <nowiki>http://ntfl.hanyang.ac.kr/index2.asp</nowiki>
* 고분자물리화학연구실 : <nowiki>http://micelle.hanyang.ac.kr/new/index.html</nowiki>
* 푸른유기합성연구실 : <nowiki>http://cafe.daum.net/greenchemistry</nowiki>
* 이론화학연구실 : <nowiki>http://charmm.kr/</nowiki>
* 유기합성연구실 : <nowiki>http://osl.hanyang.ac.kr/index2.asp</nowiki>
* 나노환경연구실 : <nowiki>http://ncec.hanyang.ac.kr/</nowiki>
* 유기박막연구실 : <nowiki>http://otfl.hanyang.ac.kr/index2.asp</nowiki>
* 생리활성분자합성연구실 : <nowiki>http://bmsl.hanyang.ac.kr/index2.asp</nowiki>
* 고성능나노재료&소자연구실 : <nowiki>https://sites.google.com/site/thechoigroup1/</nowiki>
* 무기나노화학연구실 : <nowiki>http://inml.hanyang.ac.kr/index2.asp</nowiki>
==물리과==
* 유기광전자재료연구실 : <nowiki>http://opem.campushomepage.com/index2.asp</nowiki>
* 표면분자과학연구실 : <nowiki>http://smsl.camhome.co.kr/index2.asp</nowiki>
* 분자유전공학연구실 : <nowiki>https://sites.google.com/site/hanyangmgel/</nowiki>
* 나노복합박막연구실 : <nowiki>http://ntfl.hanyang.ac.kr/index2.asp</nowiki>
* 고분자물리화학연구실 : <nowiki>http://micelle.hanyang.ac.kr/new/index.html</nowiki>
* 푸른유기합성연구실 : <nowiki>http://cafe.daum.net/greenchemistry</nowiki>
==생명과==
* 물환경 생태복원연구실 : <nowiki>http://ecohanyang.com/members_laboratory.html</nowiki>
* 생물다양성연구실 : <nowiki>http://wlee11.wix.com/biodivelab</nowiki>
* 분자생화학연구실 : <nowiki>http://molbiochem.hanyang.ac.kr/</nowiki>
* 식물생명공학연구실 : <nowiki>http://hpbl.dsso.kr/</nowiki>
* 식물신호전달연구실 : <nowiki>https://sites.google.com/site/labofplantsignaltransduction/</nowiki>
* 나노바이오연구실 : <nowiki>https://sites.google.com/site/ypkimlab/</nowiki>
