국가 및 기업이 운영예산과 연구비를 지원하여 육성하는 연구집단으로 전국적인 경쟁을 통해 유치한 것으로, 외부 지정 연구센터는 본교 교수들이 주축이 되고 타 대학 등 교외 기관의 우수 연구자들이 참여하여 연구를 수행
유치 현황(2012)
서울캠퍼스
- 중소기업산학협력센터, 지원기관: 중소기업청, 선정년도: 2001, 사업기간: 2001~현재
- 차세대메모리개발사업단, 지원기관: 한국산업기술평가관리원, 선정년도: 2004, 사업기간: 2004~2012
- 하이브리드자동차교육센터, 지원기관: 산업통상자원부, 선정년도: 2004, 사업기간: 2004~현재
- 생체인공근육연구단, 지원기관:한국연구재단, 선정년도: 2006, 사업기간: 2006~2015
- 아태지역연구센터, 지원기관:한국연구재단, 선정년도: 2007, 사업기간: 2007~2017
- 삼성테크윈무선인식통신기술연구센터, 지원기관: 삼성테크윈, 선정년도: 2008, 사업기간: 2008~2013
- 류마티스관절염임상연구센터, 지원기관: 한국보건산업진흥원, 선정년도: 2008, 사업기간: 2008~2015
- 차세대연료감응태양전지기술센터, 지원기관: 한국연구재단, 선정년도: 2008, 사업기간: 2008~2015
- 줄기세포행동제어연구센터, 지원기관:한국연구재단, 선정년도: 2008, 사업기간: 2008~2017
- 비교역사문화연구소, 지원기관: 한국연구재단, 선정년도: 2008, 사업기간: 2008~2018
- 차세대산학연공동연구센터, 지원기관: 한국산업기술평가관리원, 선정년도: 2009, 사업기간: 2009~2012
- 네트워크기반지능형로봇교육센터(로봇특성화대학원지원사업단), 지원기관: 한국로봇산업진흥원, 선정년도: 2009, 사업기간: 2009~2014
- 수소연료전지특성화사업단, 지원기관: 한국에너지기술평가원, 선정년도: 2009, 사업기간: 2009~2014
- 난치성신경계질환세포치료센터, 지원기관: 한국보건산업진흥원, 선정년도: 2010, 사업기간: 2010~2015
- 스토리지연구센터, 지원기관: 한국산업기술평가관리원, 선정년도: 2010, 사업기간: 2010~2015
- 멀티미디어시스템반도체연구센터, 지원기관: 정보통신산업진흥원, 선정년도: 2011, 사업기간: 2011~2014