1990
- 1996년 3월 한양대학교의 미래지향적 융합연구를 위해 창설 (초대 주임교수 김선일 교수)
- 1997년 대한의용생체공학회 추계학술대회 한양대학교 최초로 유치
- 1999년에는 BK21 핵심분야로 선정, 한양엑스포 출품 및 입상
2000
- 2000년에는 국가지정연구소(NRL)로 선정되어 교수인력을 유치하고, 국제 심포지움을 공동개최
- 2001년에는 실험실창업으로 (벤쳐기업)-(주)메디컬스탠다드(대표:김선일 교수님)와 (벤쳐기업)-(주)싸이코텍 (대표:김인영 교수님)를 설립
- 2003년 CISS센터에 선정됨과 동시에 김선일 교수가 한국과학재단 기초연구단장으로 취임
- 2005년 공과대학에 학부 생체공학과가 신설, 본 연구소에서 대한뇌기능매핑학회 추계학술대회를 유치
- 2005년 김선일 교수 최우수교수상을 수상
- 2005년 한양대학교 의생명과학연구원 산하기관 의공학연구소로 신설
- 2006년 김선일 교수 World Congress 2006 SEOUL의 조직위원장을 맡아 성황리에 행사를 치르도록 운영
- 2007년 국가지정연구소(NRL) 선정에 따라 독립기관인 의공학연구소로 신설 (소장: 김선일 교수)
- 2007년 BK21 핵심분야로 선정된 인공근육 창의연구단 소장에 김선정 교수
- 2008년 김선일 교수 대한의용생체공학회 회장으로 취임, 다시 한 번 한양대학교에서 대한의용생체공학회 추계학술대회를 유치
- 2008년 김인영 교수 최우수교수상을 수상
- 2008년 김선일 교수 공과대학 학부 생체공학전공의 소장으로 취임
- 2009년 김선정 교수 최우수교수상 수상
- 2009년 국립암센터와 학연산협동과정 협약
2010
- 2011년 의생명전문대학원에 생체의공학과 신설
- 2013년 일반대학원에 생체공학과 신설
- 2013년 한양 BME심포지엄을 'Recent Advances in Brain-Computer Interfaces'를 주제로 개최
- 2014년 장동표 교수 우수강의교수상 수상
- 2014년 김선정 교수 한국연구재단으로부터 기초연구 우수성과상 수상
- 2015년 임창환 교수가 강의우수교수상을 수상
- 2015년 김선정 교수 국가연구개발 우수성과 100선
- 2016년 임창환 교수 한양대학교 Best Teacher에 선정
- 2017년 유홍기 교수 대한의용생체공학회로부터 젊은의공학자상을 수상
- 2017년 김선정 교수와 유홍기 교수 한양대학교 내 연구실적 우수교원으로 선정